武夷学院是硕士学位授权单位，土木工程与建筑学院参与学校资源环境专业学位硕士点的建设和招生。同时，土木工程与建筑学院先后与福州大学土木工程学院、福建农林大学交通与土木工程学院建立联合培养渠道，开展联合培养研究生教育工作。